Forum Linux.général grep et recherche approximative

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3
7
août
2019

Bonjour à tous,
Je suis nouveau sur ce forum car je rencontre un problème pour lequel je n'ai pas trouvé de solution sur internet…
Je travaille sur des séquences d'ADN, mais elle sont traitées ici comme du texte avec un alphabet de seulement 4 lettres A, T, G et C. Parmi les millions de séquences obtenues, je recherche celles qui ont un motif très particulier (par exemple CTAAACAGTCTTTTTTT). Avec grep, pas de soucis, j'arrive à extraire ce qui m'intéresse, mais (…)