Forum Programmation.java Mysql et jdbc : problème de connection sous linux

Bonjour tout le monde,

J'ai un souci avec une appli Java/JSP que j'essaie de faire tourner sous linux.
Je la lance avec netbeans et glassfish.
Quand j'essaie de me connecter à la base de données une exception est générée.
J'arrive à me connecter avec le client en ligne de commande et avec la gui d'administration de mysql 5.1 (sous Madnriva 2008.1) mais j'ai un problème bizarre, quand j'essaie d'ouvrir une table pour afficher les données, mysql me demande une nouvelle connexion j'entre alors les mêmes paramètres de connexion et ça marche.
Je ne sais pas si le problème vient de glassfish (que je n'avais encore jamais utilisé (j'utilisais tomcat) ou des paramètres de la db ( - mais j'ai testé en root donc ça doit être soit le driver soit glassfish).

deployed with moduleid = freemix
The log message is null.
com.mysql.jdbc.CommunicationsException: Communications link failure due to underlying exception:
** BEGIN NESTED EXCEPTION **
java.net.ConnectException
MESSAGE: Connection refused
STACKTRACE:
java.net.ConnectException: Connection refused
at java.net.PlainSocketImpl.socketConnect(Native Method)
at java.net.PlainSocketImpl.doConnect(PlainSocketImpl.java:333)
at java.net.PlainSocketImpl.connectToAddress(PlainSocketImpl.java:195)
at java.net.PlainSocketImpl.connect(PlainSocketImpl.java:182)
at java.net.SocksSocketImpl.connect(SocksSocketImpl.java:366)
at sun.reflect.NativeMethodAccessorImpl.invoke0(Native Method)
at sun.reflect.NativeMethodAccessorImpl.invoke(NativeMethodAccessorImpl.java:39)
at sun.reflect.DelegatingMethodAccessorImpl.invoke(DelegatingMethodAccessorImpl.java:25)
at java.lang.reflect.Method.invoke(Method.java:597)
at com.sun.enterprise.server.ss.provider.ASPlainSocketImpl$2.run(ASPlainSocketImpl.java:419)
at java.security.AccessController.doPrivileged(Native Method)
at com.sun.enterprise.server.ss.provider.ASPlainSocketImpl._invoke(ASPlainSocketImpl.java:416)
at com.sun.enterprise.server.ss.provider.ASPlainSocketImpl.connect(ASPlainSocketImpl.java:288)
at com.sun.enterprise.server.ss.provider.ASClientSocketImpl.connect(ASClientSocketImpl.java:267)
at java.net.Socket.connect(Socket.java:519)
at java.net.Socket.connect(Socket.java:469)
at java.net.Socket.(Socket.java:366)
at java.net.Socket.(Socket.java:209)
at com.mysql.jdbc.StandardSocketFactory.connect(StandardSocketFactory.java:256)
at com.mysql.jdbc.MysqlIO.(MysqlIO.java:271)
at com.mysql.jdbc.Connection.createNewIO(Connection.java:2771)
at com.mysql.jdbc.Connection.(Connection.java:1555)
at com.mysql.jdbc.NonRegisteringDriver.connect(NonRegisteringDriver.java:285)
at java.sql.DriverManager.getConnection(DriverManager.java:582)
at java.sql.DriverManager.getConnection(DriverManager.java:185)
at com.eit.freemix.GetData.getConnection(GetData.java:78)
at com.eit.freemix.GetData.(GetData.java:27)
at org.apache.jsp.mixer1_jsp._jspService(mixer1_jsp.java from :67)
at org.apache.jasper.runtime.HttpJspBase.service(HttpJspBase.java:93)
at javax.servlet.http.HttpServlet.service(HttpServlet.java:831)
at org.apache.jasper.servlet.JspServletWrapper.service(JspServletWrapper.java:373)
at org.apache.jasper.servlet.JspServlet.serviceJspFile(JspServlet.java:470)
at org.apache.jasper.servlet.JspServlet.service(JspServlet.java:364)
at javax.servlet.http.HttpServlet.service(HttpServlet.java:831)
at org.apache.catalina.core.ApplicationFilterChain.servletService(ApplicationFilterChain.java:411)
at org.apache.catalina.core.ApplicationFilterChain.internalDoFilter(ApplicationFilterChain.java:317)
at org.apache.catalina.core.ApplicationFilterChain.doFilter(ApplicationFilterChain.java:198)
at org.netbeans.modules.web.monitor.server.MonitorFilter.doFilter(MonitorFilter.java:390)
at org.apache.catalina.core.ApplicationFilterChain.internalDoFilter(ApplicationFilterChain.java:230)
at org.apache.catalina.core.ApplicationFilterChain.doFilter(ApplicationFilterChain.java:198)
at org.apache.catalina.core.StandardWrapperValve.invoke(StandardWrapperValve.java:288)
at org.apache.catalina.core.StandardContextValve.invokeInternal(StandardContextValve.java:271)
at org.apache.catalina.core.StandardContextValve.invoke(StandardContextValve.java:202)
at org.apache.catalina.core.StandardPipeline.doInvoke(StandardPipeline.java:632)
at org.apache.catalina.core.StandardPipeline.doInvoke(StandardPipeline.java:577)
at com.sun.enterprise.web.WebPipeline.invoke(WebPipeline.java:94)
at org.apache.catalina.core.StandardHostValve.invoke(StandardHostValve.java:206)
at org.apache.catalina.core.StandardPipeline.doInvoke(StandardPipeline.java:632)
at org.apache.catalina.core.StandardPipeline.doInvoke(StandardPipeline.java:577)
at org.apache.catalina.core.StandardPipeline.invoke(StandardPipeline.java:571)
at org.apache.catalina.core.ContainerBase.invoke(ContainerBase.java:1080)
at org.apache.catalina.core.StandardEngineValve.invoke(StandardEngineValve.java:150)
at org.apache.catalina.core.StandardPipeline.doInvoke(StandardPipeline.java:632)
at org.apache.catalina.core.StandardPipeline.doInvoke(StandardPipeline.java:577)
at org.apache.catalina.core.StandardPipeline.invoke(StandardPipeline.java:571)
at org.apache.catalina.core.ContainerBase.invoke(ContainerBase.java:1080)
at org.apache.coyote.tomcat5.CoyoteAdapter.service(CoyoteAdapter.java:272)
at com.sun.enterprise.web.connector.grizzly.DefaultProcessorTask.invokeAdapter(DefaultProcessorTask.java:637)
at com.sun.enterprise.web.connector.grizzly.DefaultProcessorTask.doProcess(DefaultProcessorTask.java:568)
at com.sun.enterprise.web.connector.grizzly.DefaultProcessorTask.process(DefaultProcessorTask.java:813)
at com.sun.enterprise.web.connector.grizzly.DefaultReadTask.executeProcessorTask(DefaultReadTask.java:341)
at com.sun.enterprise.web.connector.grizzly.DefaultReadTask.doTask(DefaultReadTask.java:263)
at com.sun.enterprise.web.connector.grizzly.DefaultReadTask.doTask(DefaultReadTask.java:214)
at com.sun.enterprise.web.portunif.PortUnificationPipeline$PUTask.doTask(PortUnificationPipeline.java:380)
at com.sun.enterprise.web.connector.grizzly.TaskBase.run(TaskBase.java:265)
at com.sun.enterprise.web.connector.grizzly.ssl.SSLWorkerThread.run(SSLWorkerThread.java:106)
** END NESTED EXCEPTION **
Last packet sent to the server was 2 ms ago.
at com.mysql.jdbc.Connection.createNewIO(Connection.java:2847)
at com.mysql.jdbc.Connection.(Connection.java:1555)
at com.mysql.jdbc.NonRegisteringDriver.connect(NonRegisteringDriver.java:285)
at java.sql.DriverManager.getConnection(DriverManager.java:582)
at java.sql.DriverManager.getConnection(DriverManager.java:185)
at com.eit.freemix.GetData.getConnection(GetData.java:78)
at com.eit.freemix.GetData.(GetData.java:27)
at org.apache.jsp.mixer1_jsp._jspService(mixer1_jsp.java from :67)
at org.apache.jasper.runtime.HttpJspBase.service(HttpJspBase.java:93)
at javax.servlet.http.HttpServlet.service(HttpServlet.java:831)
at org.apache.jasper.servlet.JspServletWrapper.service(JspServletWrapper.java:373)
at org.apache.jasper.servlet.JspServlet.serviceJspFile(JspServlet.java:470)
at org.apache.jasper.servlet.JspServlet.service(JspServlet.java:364)
at javax.servlet.http.HttpServlet.service(HttpServlet.java:831)
at org.apache.catalina.core.ApplicationFilterChain.servletService(ApplicationFilterChain.java:411)
at org.apache.catalina.core.ApplicationFilterChain.internalDoFilter(ApplicationFilterChain.java:317)
at org.apache.catalina.core.ApplicationFilterChain.doFilter(ApplicationFilterChain.java:198)
at org.netbeans.modules.web.monitor.server.MonitorFilter.doFilter(MonitorFilter.java:390)
at org.apache.catalina.core.ApplicationFilterChain.internalDoFilter(ApplicationFilterChain.java:230)
at org.apache.catalina.core.ApplicationFilterChain.doFilter(ApplicationFilterChain.java:198)
at org.apache.catalina.core.StandardWrapperValve.invoke(StandardWrapperValve.java:288)
at org.apache.catalina.core.StandardContextValve.invokeInternal(StandardContextValve.java:271)
at org.apache.catalina.core.StandardContextValve.invoke(StandardContextValve.java:202)
at org.apache.catalina.core.StandardPipeline.doInvoke(StandardPipeline.java:632)
at org.apache.catalina.core.StandardPipeline.doInvoke(StandardPipeline.java:577)
at com.sun.enterprise.web.WebPipeline.invoke(WebPipeline.java:94)
at org.apache.catalina.core.StandardHostValve.invoke(StandardHostValve.java:206)
at org.apache.catalina.core.StandardPipeline.doInvoke(StandardPipeline.java:632)
at org.apache.catalina.core.StandardPipeline.doInvoke(StandardPipeline.java:577)
at org.apache.catalina.core.StandardPipeline.invoke(StandardPipeline.java:571)
at org.apache.catalina.core.ContainerBase.invoke(ContainerBase.java:1080)
at org.apache.catalina.core.StandardEngineValve.invoke(StandardEngineValve.java:150)
at org.apache.catalina.core.StandardPipeline.doInvoke(StandardPipeline.java:632)
at org.apache.catalina.core.StandardPipeline.doInvoke(StandardPipeline.java:577)
at org.apache.catalina.core.StandardPipeline.invoke(StandardPipeline.java:571)
at org.apache.catalina.core.ContainerBase.invoke(ContainerBase.java:1080)
at org.apache.coyote.tomcat5.CoyoteAdapter.service(CoyoteAdapter.java:272)
at com.sun.enterprise.web.connector.grizzly.DefaultProcessorTask.invokeAdapter(DefaultProcessorTask.java:637)
at com.sun.enterprise.web.connector.grizzly.DefaultProcessorTask.doProcess(DefaultProcessorTask.java:568)
at com.sun.enterprise.web.connector.grizzly.DefaultProcessorTask.process(DefaultProcessorTask.java:813)
at com.sun.enterprise.web.connector.grizzly.DefaultReadTask.executeProcessorTask(DefaultReadTask.java:341)
at com.sun.enterprise.web.connector.grizzly.DefaultReadTask.doTask(DefaultReadTask.java:263)
at com.sun.enterprise.web.connector.grizzly.DefaultReadTask.doTask(DefaultReadTask.java:214)
at com.sun.enterprise.web.portunif.PortUnificationPipeline$PUTask.doTask(PortUnificationPipeline.java:380)
at com.sun.enterprise.web.connector.grizzly.TaskBase.run(TaskBase.java:265)
at com.sun.enterprise.web.connector.grizzly.ssl.SSLWorkerThread.run(SSLWorkerThread.java:106)
PWC1412: WebModule[/web] ServletContext.log():PWC1409: Marking servlet dwr-invoker as unavailable
WebModule[/web]Error loading WebappClassLoader


Tant que j'y suis j'ai un autre souci avec un disque externe qui est reconnu comme /dev/sda mais quand je branche une clé usb ou un APN, le disque est reconnu comme /dev/sdb ou encore disparaît de la liste des périphériques ce qui fait que je ne sais pas quoi écrire dans /etc/fstab pour qu'il soit toujours monté au même endroit...

Un 3e problème est que Netbeans ne démarre pas quand je le lance avec l'utilisateur normal il faut que je le lance en root (arghh) sinon j'ai une erreur:

Cannot read cluster file: /usr/local/netbeans-6.1/bin/../etc/netbeans.clusters

En fait j'avais activé le mode de sécurité parano et j'ai changé après vers "plus élevée. Je ne sais pas quoi faire à part réinstaller netbeans.

Voilà merci et bon week-end...