Journal Préparation de figures avec R : automatiser l'ajout d'annotations manuelles

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sept.
2021

R est un outil libre destiné aux statistiques utilisé pour l'analyse de données et la production de figures scientifiques. Une bonne reproductibilité des résultats peut être obtenue en utilisant des scripts R et un logiciel de gestion de version comme Git. Néanmoins, il est parfois pratique d'ajouter quelques annotations à la main sur une figure, ce qui va à l'encontre de la reproductibilité désirée.

Ce journal présente une approche permettant d'incorporer ces annotations manuelles dans une figure de manière (…)

Le logiciel libre au cœur du Deuxième Plan national pour la science ouverte

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10
juil.
2021
Science

Le Deuxième Plan national pour la science ouverte a été publié récemment par le Ministère de la Recherche.

Parmi les quatre axes d’action de ce plan, qui sont par ailleurs tous intéressants, on note en particulier l’axe 3 : « Ouvrir et promouvoir les codes sources produits par la recherche », avec les mesures suivantes :

  • valoriser et soutenir la diffusion sous licence libre des codes sources issus de recherches financées sur fonds publics ;
  • mettre en valeur la production des codes sources de l’enseignement supérieur, de la recherche et de l’innovation ;
  • définir et promouvoir une politique en matière de logiciel libre.

Le document met en particulier en exergue les deux éléments suivants :

  • L’ouverture des codes source des logiciels est un enjeu majeur de reproductibilité des résultats scientifiques.
  • La diffusion des productions logicielles sous licence libre sera privilégiée.

Statistiques sur la vulgarisation scientifique en français sur Youtube

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24
mai
2021
Science

Quatre chercheurs ont co-écrit un article analysant la vulgarisation scientifique en français sur Youtube, publié dans Frontiers in Communication en avril 2021.

Tania Louis (« médiatrice scientifique et conceptrice de contenus pédagogiques », docteure en biologie), Pierre Masselot (« BSc MSc PhD Research Fellow in Environmental Epidemiology and Statistics »), Tobias Füchslin (« Senior Researcher and Coordinator at the Swiss Academies of Arts and Sciences ») et Stéphane Debove (« docteur en biologie/psychologie de l’évolution » ou Homo Fabulus) ont « analysé plus de 600 chaînes et 70 000 vidéos de vulgarisation scientifique en français, et complété cette analyse par un sondage auprès de 180 youtubeurs. »

Journal Une dernière chance pour le magazine scientifique papier

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10
mai
2021

J'hésitais à ne déclarer qu'un lien, mais finalement je pense qu'il y a de quoi écrire un journal.

On voit petit à petit les magazines mourir, transformés en sites internet mêlant contenu éditorial et commercial, avec des articles non sourcés écrits par des prestataires de services sans journalistes. Le destin de France soir, devenu un blog putassier prêt à raconter n'importe quoi pour attirer du clic, menace beaucoup de titres aujourd'hui.

L'année dernière, le magazine Science & vie a commencé (…)

MathMod 11.0, modélisation et manipulation d'objets mathématiques

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17
mar.
2021
Science

Je suis heureux d’annoncer la sortie de la version 11.0 de MathMod (anciennement connu sous le nom K3DSurf), le logiciel libre de modélisation et de manipulation des objets mathématiques décrits par des équations implicites ou paramétriques. Cette version contient le développement le plus excitant depuis le support des processeurs multi-cœurs : compatibilité avec OpenGLES. MathMod peut maintenant tirer pleinement parti des CPU et GPU modernes !

VTK : la visualisation scientifique et au delà !

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4
fév.
2021
Science

VTK est une bibliothèque libre incontournable de la visualisation scientifique, pourtant peu citée sur LinuxFr. Rattrapons le retard !

Logo de VTK

VTK est en quelque sorte le couteau suisse de la visualisation scientifique. La suite de cet article vous donnera un aperçu de ses domaines d’utilisation en s’appuyant sur de nombreux exemples abondamment illustrés.